Struktur organisasi yang efisien dan sistem kepemimpinan yang demokratis serta pemberian otonomi pengelolaan fakultas oleh lembaga merupakan kekuatan Fakultas Ekonomi Dan Bisnis Universitas Muhammadiyah Pontianak. Disamping itu telah tersedianya Renstra Fakultas juga merupakan salah satu kekuatan yang dimiliki oleh fakultas dalam mewujudkan tata pamong yang baik.
 
Saat ini Fakultas Ekonomi Dan Bisnis Universitas Muhammadiyah Pontianak memiliki dua program studi yaitu Program Studi Manajemen dan Program Studi Bisnis Digital, untuk itu tata pamongnya disederhanakan hanya terdiri dari Dekan, Wakil Dekan, Ketua Program Studi dan Sekretaris Program Studi, seperti dijelaskan di bawah ini:
 
Dekan: Dedi Hariyanto, SE, MM
 
Wakil Dekan: Heni Safitri, SE, MM
 
Ketua Program Studi Manajemen: Neni Triana M., SE, MM
 
Sekretaris Program Studi Manajemen: Irfan Mahdi, SE, MM
 
Ketua Program Studi Bisnis Digital: Fita Kurniasari, SMB, MAB